子宫壁的表层是内膜，月经就在这里产生。经期结束后，在卵巢分泌的雌激素作用下，内膜细胞开始生长，第5～9天时一层薄薄的内膜覆盖了整个子宫表面，然后逐渐增厚，子宫腺体逐渐增多。第15天卵巢已排卵，内膜受孕激素的刺激继续增厚，厚度可达5～6mm。第25天，如果卵子没有受精，雌孕激素水平就会下降，腺体缩小，内膜逐渐变薄。最后内膜失去支持而剥落，表现为月经来潮。在子宫，这样的剧目每月上演一次。
有10%的生育期女性会出现子宫内膜逆流，顺着输卵管到达腹腔、卵巢、甚至是直肠的部位，造成子宫内膜异位，并每月受激素控制发生局部出血，导致周围组织出现炎症、水肿，产生痛经。此外，如果宫颈管狭窄或子宫位置异常，会影响经血排出而引起痛经，子宫肌瘤、内分泌紊乱引起的子宫不正常收缩也会出现痛经。
